Di bawah Raja Ferdinand dari Aragon, pengaruh Inkuisisi semakin meningkat. Pada April 1484, di Tarason, kortir Kerajaan Aragon, dalam sebuah dewan rahasia yang terdiri dari orang-orang yang dipanggil oleh raja, diangkat ke posisi kepala inkuisitor Kerajaan Castile kepada Thomas Torquemade. Thomas Torquemada menunjuk para inkuisitor dari saudara keuskupan Zaragoza, Gaspar Huglar, seorang biarawan Dominika, dan Dr. Pedro Arbuez d’Epilou, kanon Gereja Metropolitan.
Dekrit Kerajaan memerintahkan pemerintah provinsi untuk membantu mereka. Pada bulan Mei dan Juni, Penyelidik Baru melakukan beberapa dauph umum dan khidmat dan menyerahkan kepada pengadilan sekuler tersangka yang malang, yang dibakar. Eksekusi-eksekusi ini semakin menjengkelkan orang-orang Kristen baru kerajaan Aragon, yang berharap segera melihat dimulainya kembali adegan-adegan yang terjadi di Castile, tempat pengadilan, yang didirikan tiga tahun lalu, telah membunuh ribuan korban di bawah kendali para biarawan dan pastor fanatik.
Orang Aragon melihat bahwa semua upaya mereka untuk mencegah pembentukan Inkuisisi di antara mereka sia-sia, dan memutuskan untuk mengorbankan satu atau dua inkuisitor untuk mengintimidasi yang lain. Mereka yakin bahwa setelah peristiwa ini tidak akan ada lagi keraguan tentang suasana hati yang populer, bahwa tidak ada yang berani menjadi inkuisitor, dan raja sendiri akan meninggalkan niat aslinya karena takut akan gerakan pemberontak yang dapat meletus di Castile dan Aragon. “Ketika proyek pembunuhan konspirator disetujui, mereka mulai mencari pembunuh untuk menyingkirkan Dr. Pedro Arbuez d’Epila, inkuisitor utama Zaragoza. Upaya pembunuhan mereka gagal beberapa kali. Pedro Arbuez, yang mengetahui niat ini, mengambil tindakan pencegahan agar kurang berisiko.
Untuk melindungi dirinya dari pukulan para pembunuh, inkuisitor mengenakan surat berantai di bawah pakaiannya dan sesuatu seperti helm besi yang ditutupi dengan topi bundar. Pada saat pembunuhan di gereja metropolitan, ia berlutut oleh salah satu kolom gereja, di mana sekarang ada podium untuk rasul; lenteranya berdiri di sampingnya, dan sebuah tongkat tebal bersandar pada kolom. Pada tanggal 15 September 1485, setelah pukul sebelas malam, sementara kanon di altar gereja membacakan doa pagi, Juan d’Eperaindeo, bersenjatakan pedang, mendekatinya, memukulnya dengan pisau dengan tangan kiri. Vidal d’Uranso, diperingatkan oleh Juan d’Abadia bahwa ia perlu dipukuli di leher, memukulnya dari belakang, merobek pelindung kepala di tempatnya, dan membuat luka yang sangat dalam di kepalanya sehingga Inkuisitor meninggal dunia dua hari kemudian, yaitu, 17 September.
Perhitungan politik menginspirasinya, seperti Isabella, untuk menghormati ingatan Arbuez dengan semacam kekhidmatan, yang memberikan kontribusi besar untuk melewatinya sebagai orang suci dan mengelilinginya dengan kultus khusus di gereja-gereja. Ini terjadi jauh kemudian, ketika Paus Alexander VII pada 17 Agustus 1664 memberi peringkat Arbues sebagai yang diberkati, sebagai martir bagi iman. Dan pada waktunya makam yang megah didirikan kepadanya, dan tubuhnya dibaringkan pada tanggal 8 Desember 1487. “